Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
NFKB2Q00653 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKB2Q00653 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms