Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELF3P78545 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELF3P78545 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELF3P78545 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ELF3P78545 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ELF3P78545 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ELF3P78545 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ELF3P78545 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ELF3P78545 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ELF3P78545 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELF3P78545 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELF3P78545 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELF3P78545 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ELF3P78545 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELF3P78545 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELF3P78545 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELF3P78545 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELF3P78545 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELF3P78545 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELF3P78545 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELF3P78545 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELF3P78545 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ELF3P78545 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ELF3P78545 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELF3P78545 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ELF3P78545 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF3P78545 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF3P78545 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF3P78545 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF3P78545 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF3P78545 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF3P78545 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF3P78545 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELF3P78545 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELF3P78545 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms