Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX3P78415 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX3P78415 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX3P78415 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX3P78415 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX3P78415 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX3P78415 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX3P78415 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX3P78415 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX3P78415 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IRX3P78415 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX3P78415 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX3P78415 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX3P78415 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX3P78415 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX3P78415 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX3P78415 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX3P78415 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX3P78415 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX3P78415 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX3P78415 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IRX3P78415 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX3P78415 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX3P78415 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX3P78415 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX3P78415 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX3P78415 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX3P78415 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX3P78415 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX3P78415 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX3P78415 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IRX3P78415 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX3P78415 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX3P78415 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX3P78415 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX3P78415 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX3P78415 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX3P78415 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX3P78415 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX3P78415 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IRX3P78415 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IRX3P78415 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IRX3P78415 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IRX3P78415 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IRX3P78415 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX3P78415 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX3P78415 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX3P78415 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX3P78415 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX3P78415 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX3P78415 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX3P78415 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX3P78415 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX3P78415 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IRX3P78415 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms