Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RPS28P62857 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RPS28P62857 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RPS28P62857 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RPS28P62857 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS28P62857 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS28P62857 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms