Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPS3AP61247 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPS3AP61247 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms