Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D3P61077 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms