Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB2AP61019 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB2AP61019 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms