Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVFRD-1P60508 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVFRD-1P60508 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms