Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST1P52848 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST1P52848 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST1P52848 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDST1P52848 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST1P52848 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST1P52848 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST1P52848 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST1P52848 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST1P52848 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST1P52848 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST1P52848 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST1P52848 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST1P52848 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST1P52848 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDST1P52848 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDST1P52848 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDST1P52848 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDST1P52848 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDST1P52848 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NDST1P52848 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDST1P52848 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDST1P52848 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDST1P52848 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST1P52848 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST1P52848 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST1P52848 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDST1P52848 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST1P52848 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST1P52848 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST1P52848 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST1P52848 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST1P52848 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST1P52848 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST1P52848 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST1P52848 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST1P52848 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST1P52848 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST1P52848 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDST1P52848 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST1P52848 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST1P52848 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST1P52848 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST1P52848 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST1P52848 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST1P52848 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST1P52848 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDST1P52848 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST1P52848 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST1P52848 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST1P52848 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST1P52848 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST1P52848 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST1P52848 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST1P52848 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST1P52848 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST1P52848 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST1P52848 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST1P52848 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDST1P52848 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST1P52848 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST1P52848 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST1P52848 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST1P52848 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST1P52848 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDST1P52848 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms