Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCT8P50990 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCT8P50990 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCT8P50990 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8P50990 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8P50990 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8P50990 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8P50990 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8P50990 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8P50990 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8P50990 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8P50990 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8P50990 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCT8P50990 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCT8P50990 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8P50990 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8P50990 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8P50990 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8P50990 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCT8P50990 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms