Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERFP50548 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERFP50548 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERFP50548 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERFP50548 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERFP50548 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERFP50548 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERFP50548 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERFP50548 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERFP50548 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERFP50548 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERFP50548 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERFP50548 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERFP50548 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERFP50548 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERFP50548 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERFP50548 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERFP50548 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERFP50548 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERFP50548 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERFP50548 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERFP50548 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERFP50548 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERFP50548 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERFP50548 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERFP50548 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERFP50548 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERFP50548 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERFP50548 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERFP50548 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERFP50548 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERFP50548 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERFP50548 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERFP50548 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERFP50548 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERFP50548 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERFP50548 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERFP50548 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERFP50548 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERFP50548 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERFP50548 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERFP50548 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERFP50548 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERFP50548 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERFP50548 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERFP50548 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERFP50548 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERFP50548 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERFP50548 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERFP50548 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERFP50548 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERFP50548 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERFP50548 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERFP50548 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERFP50548 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERFP50548 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERFP50548 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERFP50548 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERFP50548 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERFP50548 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERFP50548 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERFP50548 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERFP50548 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERFP50548 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERFP50548 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERFP50548 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERFP50548 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERFP50548 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERFP50548 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERFP50548 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERFP50548 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERFP50548 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms