Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCC3P46736 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRCC3P46736 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms