Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR1P43307 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR1P43307 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR1P43307 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR1P43307 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR1P43307 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR1P43307 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR1P43307 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSR1P43307 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSR1P43307 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSR1P43307 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSR1P43307 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSR1P43307 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSR1P43307 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSR1P43307 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR1P43307 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR1P43307 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR1P43307 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR1P43307 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR1P43307 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR1P43307 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR1P43307 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR1P43307 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR1P43307 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSR1P43307 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSR1P43307 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms