Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC1P41238 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
APOBEC1P41238 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms