Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNCAP37840 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNCAP37840 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNCAP37840 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNCAP37840 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNCAP37840 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNCAP37840 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms