Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP62P37198 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP62P37198 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP62P37198 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP62P37198 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP62P37198 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP62P37198 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP62P37198 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP62P37198 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP62P37198 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP62P37198 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP62P37198 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP62P37198 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP62P37198 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP62P37198 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP62P37198 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP62P37198 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP62P37198 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP62P37198 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP62P37198 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP62P37198 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP62P37198 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP62P37198 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP62P37198 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP62P37198 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP62P37198 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP62P37198 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP62P37198 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP62P37198 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP62P37198 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP62P37198 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP62P37198 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP62P37198 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP62P37198 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP62P37198 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP62P37198 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP62P37198 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP62P37198 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP62P37198 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP62P37198 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP62P37198 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP62P37198 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP62P37198 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms