Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJC1P36383 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJC1P36383 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJC1P36383 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJC1P36383 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJC1P36383 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJC1P36383 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJC1P36383 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJC1P36383 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJC1P36383 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJC1P36383 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJC1P36383 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJC1P36383 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJC1P36383 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJC1P36383 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJC1P36383 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJC1P36383 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJC1P36383 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJC1P36383 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJC1P36383 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJC1P36383 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJC1P36383 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJC1P36383 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJC1P36383 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJC1P36383 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GJC1P36383 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJC1P36383 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJC1P36383 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJC1P36383 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJC1P36383 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJC1P36383 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GJC1P36383 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GJC1P36383 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJC1P36383 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJC1P36383 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJC1P36383 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJC1P36383 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJC1P36383 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJC1P36383 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJC1P36383 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms