Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT2P35908 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT2P35908 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT2P35908 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT2P35908 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT2P35908 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT2P35908 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT2P35908 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT2P35908 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT2P35908 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT2P35908 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT2P35908 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT2P35908 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT2P35908 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT2P35908 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT2P35908 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT2P35908 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT2P35908 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT2P35908 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT2P35908 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT2P35908 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT2P35908 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT2P35908 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT2P35908 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT2P35908 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT2P35908 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT2P35908 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT2P35908 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT2P35908 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT2P35908 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT2P35908 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT2P35908 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT2P35908 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT2P35908 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT2P35908 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT2P35908 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT2P35908 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT2P35908 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT2P35908 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms