Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHRP34981 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHRP34981 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRHRP34981 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHRP34981 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHRP34981 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHRP34981 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHRP34981 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHRP34981 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHRP34981 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHRP34981 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHRP34981 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHRP34981 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHRP34981 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHRP34981 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRHRP34981 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRHRP34981 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRHRP34981 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRHRP34981 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRHRP34981 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRHRP34981 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRHRP34981 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRHRP34981 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRHRP34981 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRHRP34981 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRHRP34981 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRHRP34981 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRHRP34981 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRHRP34981 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRHRP34981 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRHRP34981 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRHRP34981 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRHRP34981 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRHRP34981 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRHRP34981 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRHRP34981 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRHRP34981 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRHRP34981 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRHRP34981 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRHRP34981 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRHRP34981 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRHRP34981 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRHRP34981 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRHRP34981 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRHRP34981 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRHRP34981 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRHRP34981 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRHRP34981 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRHRP34981 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRHRP34981 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms