Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM5P33992 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM5P33992 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM5P33992 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM5P33992 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM5P33992 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM5P33992 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM5P33992 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM5P33992 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM5P33992 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM5P33992 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM5P33992 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM5P33992 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM5P33992 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM5P33992 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM5P33992 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM5P33992 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM5P33992 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MCM5P33992 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MCM5P33992 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM5P33992 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM5P33992 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM5P33992 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM5P33992 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM5P33992 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM5P33992 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM5P33992 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM5P33992 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM5P33992 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM5P33992 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM5P33992 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM5P33992 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM5P33992 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM5P33992 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM5P33992 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM5P33992 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM5P33992 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM5P33992 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM5P33992 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM5P33992 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM5P33992 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM5P33992 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM5P33992 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM5P33992 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM5P33992 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM5P33992 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM5P33992 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM5P33992 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM5P33992 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM5P33992 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM5P33992 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM5P33992 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM5P33992 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM5P33992 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM5P33992 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM5P33992 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM5P33992 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM5P33992 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM5P33992 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM5P33992 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM5P33992 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM5P33992 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM5P33992 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms