Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC27P30260 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC27P30260 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC27P30260 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC27P30260 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC27P30260 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC27P30260 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC27P30260 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC27P30260 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC27P30260 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC27P30260 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC27P30260 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC27P30260 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC27P30260 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC27P30260 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC27P30260 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC27P30260 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC27P30260 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC27P30260 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC27P30260 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC27P30260 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC27P30260 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC27P30260 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC27P30260 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC27P30260 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC27P30260 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC27P30260 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC27P30260 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC27P30260 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC27P30260 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC27P30260 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC27P30260 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC27P30260 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC27P30260 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC27P30260 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC27P30260 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDC27P30260 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC27P30260 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC27P30260 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC27P30260 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC27P30260 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms