Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSFA2P28290 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSFA2P28290 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms