Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTX3P26022 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTX3P26022 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTX3P26022 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTX3P26022 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTX3P26022 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTX3P26022 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTX3P26022 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTX3P26022 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTX3P26022 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTX3P26022 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTX3P26022 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTX3P26022 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTX3P26022 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTX3P26022 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTX3P26022 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTX3P26022 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTX3P26022 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTX3P26022 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTX3P26022 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTX3P26022 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTX3P26022 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTX3P26022 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTX3P26022 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTX3P26022 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTX3P26022 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTX3P26022 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTX3P26022 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTX3P26022 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTX3P26022 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTX3P26022 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTX3P26022 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTX3P26022 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTX3P26022 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTX3P26022 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTX3P26022 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTX3P26022 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms