Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5F1P24539 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5F1P24539 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms