Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AMPD1P23109 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AMPD1P23109 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMPD1P23109 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms