Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNA5P22460 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms