Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NTF3P20783 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NTF3P20783 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NTF3P20783 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NTF3P20783 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NTF3P20783 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NTF3P20783 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NTF3P20783 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NTF3P20783 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NTF3P20783 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTF3P20783 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTF3P20783 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms