Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNA2P20248 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms