Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-DPA1P20036 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DPA1P20036 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms