Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TNNI3P19429 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNI3P19429 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms