Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF4P18848 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF4P18848 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF4P18848 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF4P18848 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATF4P18848 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATF4P18848 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATF4P18848 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATF4P18848 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATF4P18848 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATF4P18848 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATF4P18848 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATF4P18848 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATF4P18848 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATF4P18848 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATF4P18848 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATF4P18848 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATF4P18848 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATF4P18848 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATF4P18848 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATF4P18848 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATF4P18848 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATF4P18848 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATF4P18848 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms