Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC2P18074 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms