Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB8P17481 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB8P17481 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms