Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NID1P14543 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NID1P14543 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NID1P14543 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NID1P14543 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NID1P14543 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NID1P14543 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NID1P14543 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NID1P14543 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NID1P14543 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NID1P14543 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NID1P14543 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NID1P14543 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NID1P14543 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NID1P14543 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NID1P14543 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NID1P14543 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NID1P14543 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NID1P14543 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NID1P14543 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NID1P14543 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NID1P14543 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NID1P14543 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NID1P14543 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NID1P14543 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NID1P14543 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NID1P14543 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NID1P14543 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms