Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCSHP14314 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCSHP14314 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms