Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALAP11233 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALAP11233 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALAP11233 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALAP11233 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALAP11233 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALAP11233 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALAP11233 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALAP11233 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALAP11233 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALAP11233 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALAP11233 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALAP11233 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALAP11233 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALAP11233 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALAP11233 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RALAP11233 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALAP11233 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALAP11233 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RALAP11233 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALAP11233 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALAP11233 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALAP11233 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALAP11233 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALAP11233 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALAP11233 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALAP11233 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALAP11233 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALAP11233 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALAP11233 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALAP11233 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALAP11233 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALAP11233 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALAP11233 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALAP11233 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALAP11233 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALAP11233 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALAP11233 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALAP11233 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RALAP11233 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALAP11233 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RALAP11233 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALAP11233 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALAP11233 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALAP11233 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALAP11233 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RALAP11233 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALAP11233 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALAP11233 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALAP11233 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALAP11233 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALAP11233 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALAP11233 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALAP11233 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALAP11233 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALAP11233 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALAP11233 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALAP11233 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALAP11233 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALAP11233 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALAP11233 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALAP11233 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALAP11233 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALAP11233 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALAP11233 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RALAP11233 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALAP11233 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALAP11233 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RALAP11233 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms