Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PF4V1P10720 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PF4V1P10720 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms