Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYNX1P0DP58 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms