Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPBGLP0DKB5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPBGLP0DKB5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPBGLP0DKB5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPBGLP0DKB5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPBGLP0DKB5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPBGLP0DKB5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPBGLP0DKB5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPBGLP0DKB5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPBGLP0DKB5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPBGLP0DKB5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPBGLP0DKB5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGLP0DKB5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPBGLP0DKB5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPBGLP0DKB5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPBGLP0DKB5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TPBGLP0DKB5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPBGLP0DKB5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPBGLP0DKB5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms