Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAPPC2P0DI81 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRAPPC2P0DI81 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms