Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC4P0CG21 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC4P0CG21 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms