Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTAP09496 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLTAP09496 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTAP09496 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTAP09496 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTAP09496 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTAP09496 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTAP09496 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTAP09496 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTAP09496 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTAP09496 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTAP09496 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTAP09496 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLTAP09496 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTAP09496 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTAP09496 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTAP09496 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTAP09496 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTAP09496 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTAP09496 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTAP09496 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTAP09496 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTAP09496 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTAP09496 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTAP09496 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTAP09496 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTAP09496 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTAP09496 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTAP09496 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTAP09496 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTAP09496 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTAP09496 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTAP09496 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLTAP09496 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLTAP09496 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTAP09496 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTAP09496 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTAP09496 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLTAP09496 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLTAP09496 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTAP09496 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLTAP09496 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLTAP09496 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTAP09496 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTAP09496 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTAP09496 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTAP09496 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTAP09496 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTAP09496 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTAP09496 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTAP09496 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTAP09496 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTAP09496 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTAP09496 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTAP09496 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTAP09496 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTAP09496 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTAP09496 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTAP09496 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTAP09496 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTAP09496 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTAP09496 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTAP09496 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTAP09496 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLTAP09496 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTAP09496 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTAP09496 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTAP09496 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTAP09496 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTAP09496 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTAP09496 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTAP09496 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTAP09496 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLTAP09496 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLTAP09496 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLTAP09496 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTAP09496 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTAP09496 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTAP09496 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTAP09496 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTAP09496 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTAP09496 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTAP09496 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTAP09496 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTAP09496 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTAP09496 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLTAP09496 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLTAP09496 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms