Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSP90AB1P08238 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSP90AB1P08238 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms