Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOP08100 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOP08100 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOP08100 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOP08100 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOP08100 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOP08100 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOP08100 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOP08100 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOP08100 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOP08100 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOP08100 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOP08100 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOP08100 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOP08100 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOP08100 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOP08100 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOP08100 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOP08100 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOP08100 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOP08100 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOP08100 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOP08100 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOP08100 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOP08100 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOP08100 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOP08100 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOP08100 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOP08100 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOP08100 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOP08100 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOP08100 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOP08100 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOP08100 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOP08100 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOP08100 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOP08100 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOP08100 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOP08100 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOP08100 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOP08100 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOP08100 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOP08100 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOP08100 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOP08100 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOP08100 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOP08100 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOP08100 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms