Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM2P07951 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM2P07951 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM2P07951 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM2P07951 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM2P07951 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM2P07951 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM2P07951 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM2P07951 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM2P07951 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM2P07951 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM2P07951 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM2P07951 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPM2P07951 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPM2P07951 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPM2P07951 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPM2P07951 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPM2P07951 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM2P07951 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM2P07951 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM2P07951 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM2P07951 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM2P07951 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM2P07951 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM2P07951 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM2P07951 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM2P07951 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM2P07951 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPM2P07951 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPM2P07951 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM2P07951 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM2P07951 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM2P07951 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM2P07951 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM2P07951 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM2P07951 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM2P07951 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM2P07951 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPM2P07951 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM2P07951 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM2P07951 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM2P07951 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM2P07951 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPM2P07951 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPM2P07951 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms