Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFMP07197 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFMP07197 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEFMP07197 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEFMP07197 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NEFMP07197 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFMP07197 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFMP07197 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFMP07197 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFMP07197 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFMP07197 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFMP07197 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFMP07197 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEFMP07197 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFMP07197 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFMP07197 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFMP07197 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFMP07197 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEFMP07197 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFMP07197 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFMP07197 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFMP07197 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFMP07197 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFMP07197 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEFMP07197 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEFMP07197 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEFMP07197 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEFMP07197 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEFMP07197 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEFMP07197 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEFMP07197 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFMP07197 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFMP07197 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFMP07197 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFMP07197 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFMP07197 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFMP07197 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFMP07197 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFMP07197 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEFMP07197 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFMP07197 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFMP07197 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFMP07197 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFMP07197 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFMP07197 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFMP07197 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFMP07197 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFMP07197 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFMP07197 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFMP07197 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFMP07197 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEFMP07197 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEFMP07197 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFMP07197 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFMP07197 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFMP07197 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFMP07197 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFMP07197 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFMP07197 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFMP07197 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFMP07197 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFMP07197 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFMP07197 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEFMP07197 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFMP07197 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFMP07197 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFMP07197 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFMP07197 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFMP07197 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFMP07197 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEFMP07197 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFMP07197 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFMP07197 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFMP07197 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFMP07197 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFMP07197 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFMP07197 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEFMP07197 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFMP07197 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFMP07197 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFMP07197 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFMP07197 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFMP07197 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFMP07197 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFMP07197 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFMP07197 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFMP07197 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFMP07197 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms