Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPP00450 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPP00450 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPP00450 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPP00450 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPP00450 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPP00450 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPP00450 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPP00450 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPP00450 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPP00450 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPP00450 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPP00450 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPP00450 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPP00450 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPP00450 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPP00450 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPP00450 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPP00450 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPP00450 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPP00450 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPP00450 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPP00450 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPP00450 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPP00450 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPP00450 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPP00450 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPP00450 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPP00450 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPP00450 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPP00450 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPP00450 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPP00450 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPP00450 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPP00450 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPP00450 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPP00450 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPP00450 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPP00450 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPP00450 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPP00450 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPP00450 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPP00450 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPP00450 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPP00450 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPP00450 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPP00450 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPP00450 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPP00450 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPP00450 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPP00450 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPP00450 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPP00450 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPP00450 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPP00450 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPP00450 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPP00450 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPP00450 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPP00450 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPP00450 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPP00450 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPP00450 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPP00450 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPP00450 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPP00450 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPP00450 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPP00450 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPP00450 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPP00450 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPP00450 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPP00450 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPP00450 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms