Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPINO95295 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms