Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIF4AO95239 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF4AO95239 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms