Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCELO95171 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCELO95171 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCELO95171 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCELO95171 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCELO95171 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCELO95171 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCELO95171 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCELO95171 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCELO95171 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCELO95171 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCELO95171 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCELO95171 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCELO95171 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCELO95171 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCELO95171 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCELO95171 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCELO95171 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCELO95171 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCELO95171 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCELO95171 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCELO95171 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCELO95171 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCELO95171 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCELO95171 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCELO95171 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCELO95171 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCELO95171 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCELO95171 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCELO95171 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCELO95171 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCELO95171 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCELO95171 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCELO95171 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCELO95171 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCELO95171 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCELO95171 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCELO95171 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCELO95171 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCELO95171 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCELO95171 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCELO95171 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCELO95171 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCELO95171 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCELO95171 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCELO95171 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCELO95171 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCELO95171 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCELO95171 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCELO95171 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCELO95171 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCELO95171 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCELO95171 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCELO95171 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCELO95171 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCELO95171 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCELO95171 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCELO95171 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SCELO95171 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCELO95171 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCELO95171 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCELO95171 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms